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2006年，為配合NDS版（鑽石、珍珠版）的上市，TV動畫同步推出全新系列《神奇寶貝鑽石&珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl，簡稱DP）。對戰開拓區篇結束後，小遙為了獨自挑戰城都地區的華麗大賽和小智告別，小胜回到了橙華道館，小剛也回家去了。小智則受到了小茂的激勵，獨自帶著皮卡丘和偷渡的長尾怪手前往神奧地區挑戰聯盟。
